Gene: CKMT2-AS1

Basic information

HGNC Gene Symbol: CKMT2-AS1  ?
HGNC Full Gene Name: CKMT2 antisense RNA 1
Location (hg38): chr5:81204084-81301582
Strand: -
Class: antisense
Sequence Ontology term: antisense_lncRNA_gene
Transcripts: 32

Transcripts

Transcript IDLocation (hg38)Length
CKMT2-AS1:1 chr5:81300366-81301582 1217 bp
CKMT2-AS1:10 chr5:81235759-81301523 601 bp
CKMT2-AS1:11 chr5:81210101-81301497 585 bp
CKMT2-AS1:12 chr5:81204096-81301485 560 bp
CKMT2-AS1:13 chr5:81204084-81301485 572 bp
CKMT2-AS1:14 chr5:81238436-81244779 961 bp
CKMT2-AS1:15 chr5:81237565-81301546 2056 bp
CKMT2-AS1:16 chr5:81249367-81301546 1705 bp
CKMT2-AS1:17 chr5:81236123-81301546 8663 bp
CKMT2-AS1:18 chr5:81237565-81301546 2226 bp
CKMT2-AS1:19 chr5:81237828-81301546 2454 bp
CKMT2-AS1:2 chr5:81237565-81301569 2740 bp
CKMT2-AS1:20 chr5:81238517-81301546 1187 bp
CKMT2-AS1:21 chr5:81244858-81301546 895 bp
CKMT2-AS1:22 chr5:81222911-81301518 31592 bp
CKMT2-AS1:23 chr5:81235759-81301518 596 bp
CKMT2-AS1:24 chr5:81238215-81301518 1373 bp
CKMT2-AS1:25 chr5:81286696-81301518 238 bp
CKMT2-AS1:26 chr5:81296211-81301518 5308 bp
CKMT2-AS1:27 chr5:81204084-81301518 605 bp
CKMT2-AS1:28 chr5:81236123-81301518 9499 bp
CKMT2-AS1:29 chr5:81210101-81301498 586 bp
CKMT2-AS1:3 chr5:81237565-81301569 2074 bp
CKMT2-AS1:30 chr5:81242330-81242599 270 bp
CKMT2-AS1:31 chr5:81232306-81233842 1537 bp
CKMT2-AS1:32 chr5:81226136-81233319 7184 bp
CKMT2-AS1:4 chr5:81237565-81301569 2249 bp
CKMT2-AS1:5 chr5:81244858-81301560 909 bp
CKMT2-AS1:6 chr5:81237565-81301559 2069 bp
CKMT2-AS1:7 chr5:81237828-81301555 2463 bp
CKMT2-AS1:8 chr5:81237565-81301544 2224 bp
CKMT2-AS1:9 chr5:81237560-81301542 2057 bp


Locus conservation

Locus conservation?
CKMT2-AS1 no no no no

Available literature

  1. Soibam (2017), Super-lncRNAs: identification of lncRNAs that target super-enhancers via RNA:DNA:DNA triplex formation., RNA